@ondiz Aún sigo con markdown. Al googlear lo de que aparezcan los acentos he encontrado tu página https://ondahostil.wordpress.com/2015/09/03/lo-que-he-aprendido-emacs-como-editor-de-markdown/
Supongo que ya lo habrás hecho, pero después he buscado como se automatiza y lo encontré en el blog de @drymer : (setq markdown-xhtml-header-content "<meta http-equiv='Content-Type' content='text/html; charset=utf-8' />")