tar.gz, tar.bz2 y tar.xz . Yo suelo ser fan siempre de tar.gz. La mayoría de veces aciertas en que no comprimirás lo mejor del mundo pero si es para un backup de algo descomprimirás rapido. Eso se resume en poco tiempo de comprimir, transmitir y descomprimir.

Pero eso es cuando no conoces lo que quieres transmitir de una maquina a otra. Cuando analizas te das cuenta que algunas veces es mejor un xz como en el caso del kernel Linux o Blender. En otras gana bz y en otras (la mayoría gana tar.gz).

La vida.